哈哈，这个问题有意思了，火影中最后复活的究竟是大蛇丸的本体还是大蛇丸的分身？个人认为应该是大蛇丸的复制体，因为按照火影中的设定大蛇丸研究永生禁术以后已经很难区分真正的本体是哪一个了，下面具体说明一下。
大蛇丸由于经历过残酷的忍界大战，一直希望能够寻找到一种能够让自己永远存活的方法，因此掌握了类似不尸转生，身体改造和借助咒印复活的技术。
作为火影忍者中的科学狂人大蛇丸为了长生不老可以说是鞠躬尽瘁，用了各种不同的方法。不但改造了自己的身体，还研究了像不尸转生和咒印这种可以转移自己精神力量和类似克隆复制的技术，但是实际上自从大蛇丸研究这些所谓的禁术以后所谓的本体和复制体也就傻傻分不清了，我们一起来看一下：
①不尸转生：可以把大蛇丸的精神力量转移到其他人的躯体上达到延长自己精神力量留存时间的作用，但是由于剧情中大蛇丸已经多次使用过不尸转生，最原始的大蛇丸躯体是什么？在哪里已经无法判断了。
在火影前期大蛇丸比较厉害的禁术就是不尸转生了，可以把自己的精神力量（灵魂）强行转移到其他人的躯体上达到延长自己生命的效果。因此个人认为从逻辑上说自大蛇丸第一次使用不尸转生以后所谓的本体就已经不存在了，因为大蛇丸既然使用不尸转生也就证明大蛇丸原本的躯体已经由于时间推移存在身体机能下降和衰老的情况，而大蛇丸在袭击木叶村的阶段已经是使用不尸转生把自己的灵魂寄宿在一个年轻的女性身体上了。因此自从大蛇丸逃离木叶村并研究成功不尸转生以后已经做过多次类似的灵魂转移工作，后续出现的都不是大蛇丸的本体。
大蛇丸在脱离木叶村以后已经成功掌握了不尸转生，可以把自己的精神力量也就是灵魂转移到其他人的躯体内。并且已经实施过多次不尸转生，因此大蛇丸原来的本体到底在哪里已经无法判断了了解了。
②但是剧情中又说过大蛇丸为了实现永生把自己的身体改造成了类似多种蛇类的复合体，这一点与不尸转生的效果是有矛盾的。
下面就是岸本在内容设定上的问题了，既然不尸转生能够把大蛇丸的灵魂转移到另外的年轻躯体上，那么为何大蛇丸还需要改造自己的身体？个人推测是经过改造以后的躯体能够让大蛇丸的灵魂和肉体分离，但是既然后续大蛇丸使用不尸转生成功了，原来经过改造的躯体基本上就没用了啊，难度大蛇丸想不通还会把自己的灵魂转移回已经处于衰退期的躯体当中？
如果改造自己的本体可以永生大蛇丸就不需要使用不尸转生得到佐助的躯体了，因此个人认为后续出现的所谓大蛇丸本体（白磷大蛇丸同样属于大蛇丸的复制体进行改造的情况），虽然佐助的手下水月认为佐助对抗大蛇丸不尸转生时干掉的是大蛇丸本体。但是实际上是后期大蛇丸使用不尸转生之后的产物。
剧情中出现过的所谓白磷大蛇应该也是后续大蛇丸对自己复制体进行改造的杰作，大蛇丸真正的本体应该是在执行第一次不尸转生之后就已经消失掉了，后面出现的都是大蛇丸的复制体。
第四次忍界大战中佐助利用咒印和部分大蛇丸细胞复活成功的大蛇丸同样属于大蛇丸的分身。
后续出现的利用咒印复活实现永生的办法在实用性方面要比不尸转生好一些，大蛇丸研究重吾的吸收大自然能量的能力以后开发出了咒印，可以把自己的重要信息保存在咒印的持有者体内。可以利用大蛇丸的体细胞产生类似克隆的效果，最后佐助就是借助仙人兜身上的大蛇丸细胞和驭手洗红豆身上的咒印复活了大蛇丸。这个阶段出现的大蛇丸依旧属于大蛇丸的分身（真正的大蛇丸本体在第一次使用不尸转生的时候已经不存在了）。这里的关键点有几个，一个是兜身上的大蛇丸细胞来源属于大蛇丸本体还是复制体，第二就是被咒印复活以后的大蛇丸究竟算本体还是分身，我们一起来看一下：
①兜移植的大蛇丸细胞应该同样属于大蛇丸复制体，因为这个阶段的大蛇丸细胞经过特殊改造。
后期仙人兜的身体可以说是大杂烩了，融合了很多人的体细胞，不仅仅有大蛇丸的还有千手柱间的细胞。如果只讨论兜移植的大蛇丸细胞，应该是来自于后期经过身体改造以后的大蛇丸。因为大蛇丸和兜并不是一开始就建立合作关系的，兜后续跟随大蛇丸之前大蛇丸已经研究类似尸鬼封尽和咒印一段时间了。二人联手应该是在大蛇丸脱离木叶村之后，这个阶段的大蛇丸已经使用过不尸转生。因此即使后续兜得到大蛇丸细胞应该也是对于自己复制体进行改造过后的产物，而咒印复活大蛇丸的条件之一就是必须有承载咒印内储存大蛇丸遗留信息的载体。这个除了咒印持有者本身以外还需要大蛇丸细胞的作用，如果只有咒印没有大蛇丸细胞做牵引是无法使大蛇丸完全复活的。
咒印能够复活大蛇丸的条件有两个：保存有大蛇丸重要的信息，二具有大蛇丸的体细胞。才能够刺激咒印进行重组大蛇丸身体的过程。
②大蛇丸最后凭借咒印复活得到的躯体同样属于分身，最后能够顺利使用死神面具解除尸鬼封尽的原因也并不是因为复活出来的是大蛇丸本体。
大蛇丸也是够悲剧的，为了拿回双手被封印的灵魂，只能再自杀一次。最后解开尸鬼封尽以后还侵占了白绝的身体，有些火影迷就认为只有大蛇丸本体才能让被尸鬼封尽的灵魂回归。火影中可没有这种设定，如果真滴只能够让灵魂回归死者的本体，另一个技能秽土转生就无法使用了。因为秽土转生就是把已经死亡的忍者灵魂强行侵占活人载体，而通过剧情大家都知道大蛇丸被尸鬼封尽封印的只有手臂部分的灵魂，因此即使利用不尸转生把自己的灵魂强行转移到新的躯体内，大蛇丸依旧不能够使用忍术。
实际上在被尸鬼封尽封印双手以后大蛇丸无论是使用不尸转生还是咒印复活其灵魂都不是完整的，而最原始的大蛇丸本体应该出现在大蛇丸入侵木叶村的时间段，因此个人推测咒印能够留存的大蛇丸信息是有限的，灵魂信息是不可能保留的，否则如果复活出来的是大蛇丸本体其灵魂一个处于完整的状态是可以使用忍术的，而大家都知道大蛇丸被尸鬼封尽时期是利用不尸转生的复制体进行活动的，封印的是复制体中大蛇丸的灵魂，本体在大蛇丸实施第一次不尸转生的过程中已没有大蛇丸的灵魂遗留了。
后续咒印复活的只是大蛇丸的众多分身之一，想要了解大蛇丸的本体情况就需要了解大蛇丸第一次使用不尸转生的时间段，但是剧情中并没有提到过。
最后总结一下，个人认为综合大蛇丸掌握的咒印复活条件来看最后佐助复活出来的大蛇丸依旧是大蛇丸的分身之一，因为自从大蛇丸第一次使用不尸转生以后原来的本体就没有继续存在的价值了，分析不到位地方请见谅，各位有其他想法欢迎留言讨论。